"Vi har avblåst och hävt varslen [om strejk]", sa SIIFF:s ordförande Renato Mendonça till Lusa.
Det handlade om de planerade strejkerna på Humberto Delgado Airport i Lissabon mellan kl. 05.00 och 10.00 den 27-29 maj, 3-5 juni, 10-12 juni, 17-19 juni och 24-26 juni.
Vid de återstående flygplatserna och gränsövergångarna, nämligen de maritima, skulle strejken äga rum den 22 och 29 maj samt den 5, 12, 19 och 26 juni.
I onsdags utfärdade republikens president regeringsdiplomen - godkända av ministerrådet den 6 april - om ersättningen av SEF och övergångsordningen för de berörda arbetstagarna, och förutsåg svårigheter i den inledande fasen av den nya byrån.