Les réservations pour la compagnie aérienne sont déjà ouvertes et se concentrent sur les vols de correspondance pour Lufthansa à partir de ses principaux hubs de Francfort et de Munich.
Parallèlement à la filiale existante Lufthansa CityLine, la nouvelle Lufthansa City desservira à terme des liaisons intérieures et européennes à partir de ses bases de Munich et de Francfort.
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En 2024, les destinations intérieures comprendront Berlin, Brême, Cologne, Bonn, Düsseldorf, Hambourg et Hanovre.
En dehors de l'Allemagne, la compagnie aérienne desservira Bordeaux en France, ainsi que Manchester et Birmingham au Royaume-Uni.