Enligt institutet kommer Madeiras sydkust att förbli under en röd varning, den allvarligaste av en skala på tre, på grund av att höga värden för den maximala temperaturen kvarstår fram till 20:00 idag.
Prognosen pekar på maximala temperaturer på cirka 30 grader Celsius i Madeiras skärgård under de närmaste dagarna, som på de södra sluttningarna kan nå 35 grader.
Resten av skärgården är under en gul och orange varning för varmt väder.
På fastlandet är distrikten Vila Real, Bragança, Viseu, Guarda, Castelo Branco, Santarém, Portalegre, Setúbal, Évora, Beja och Faro fortfarande under gul varning på grund av värmen fram till klockan 18 på onsdagen.
IPMA förutspår för idag på kontinenten molnig eller klar himmel, skymd av rökpartiklar, som kommer från bränderna i Kanada, ibland stark vind på västkusten och en temperaturfall i södra regionen, särskilt på västkusten.
De lägsta temperaturerna kommer att variera mellan 16 grader Celsius (i Viana do Castelo och Braga) och 24 (i Castelo Branco) och de högsta mellan 27 grader (i Aveiro) och 40 (i Évora).
Den orange varningen indikerar en meteorologisk situation med måttlig till hög risk och den gula utfärdas av IPMA när det finns en risksituation för vissa aktiviteter beroende på den meteorologiska situationen.
När det gäller exponering för ultraviolett strålning (UV) placerade IPMA ön Madeira i dag i extrem risk och på onsdag i mycket hög risk.
Enligt IPMA har ön Porto Santo, de 18 distrikten på det portugisiska fastlandet och ögruppen Azorerna mycket höga nivåer av exponering för UV-strålning.
Skalan för ultraviolett strålning har fem nivåer, mellan extrem och låg risk.
För regioner med extrem risk rekommenderar IPMA att man undviker att exponera sig för solen så mycket som möjligt.
För regioner med mycket hög risk rekommenderar IPMA att man använder solglasögon med UV-filter, hatt, t-shirt, parasoll, solskyddsmedel och att man undviker att utsätta barn för solen.