Den gula varningen, som utfärdats på grund av prognosen för perioder av regn, ibland kraftigt, kommer att gälla mellan 21:00 på fredag och 06:00 på lördag.
När det gäller temperaturen kommer Funchal och Porto Santo att uppvisa en lägsta temperatur på 21 grader Celsius och en högsta temperatur på 27 grader Celsius.