El INSA señala, sin embargo, en su informe semanal que, debido al cese del estado de alerta el 1 de octubre, y al consiguiente cambio en las pruebas, "se produjo un fuerte descenso en la incidencia y el valor del Rt que puede no corresponder a una disminución real".

Las estimaciones del Instituto Nacional de Salud Ricardo Jorge indican que el 6 de octubre el índice de transmisibilidad se situó en 0,63 y el 15 de octubre subió a 0,92.

El valor medio del Rt (número de reproducción efectiva), entre el 11 y el 15 de octubre, fue de 0,88, estando su valor real entre 0,87 y 0,89 con una confianza del 95%.

El informe indica un aumento del índice de transmisibilidad en todas las regiones del país en comparación con la semana anterior, con un Rt estimado de 0,84 en el Norte, 0,88 en el Centro, 0,89 en Lisboa y Vale do Tejo, 0,79 en el Alentejo, 0,80 en el Algarve.

Sólo las Azores (1,09) y Madeira (1,22) tienen un índice de transmisibilidad superior al umbral de 1, según los datos.

Según las estimaciones del INSA, hasta el 15 de octubre se habían producido 5.512.398 casos de Covid-19 en Portugal.

En la comparación europea, Portugal tiene una tasa de notificación acumulada en 14 días de entre 120 y 239,9 casos por cada 100.000 habitantes y un Rt inferior a 1, una "tasa de notificación alta con tendencia a la baja".