Malcolm avait bon cœur, mais il était rude et inculte, comme l'était son pays. L'amour de Malcolm pour Marguerite lui permit d'adoucir son caractère, de polir ses manières et de l'aider à devenir un roi vertueux. Il lui confiait toutes les affaires domestiques et la consultait souvent pour les affaires d'État.
Marguerite s'efforça d'améliorer son pays d'adoption en promouvant les arts et l'éducation. Pour la réforme religieuse, elle encourageait les synodes et assistait aux discussions qui tentaient de mettre fin aux abus au sein de la prêtrise et du laïcat. Avec son mari, elle a fondé plusieurs églises.
Margaret n'était pas seulement une reine, mais aussi une mère. Elle et Malcolm ont eu six fils et deux filles. Margaret supervisait personnellement leur instruction religieuse et leurs autres études.
Bien qu'elle soit très impliquée dans les affaires de la maison et du pays, elle reste détachée du monde. Sa vie privée était austère. Elle consacre certains moments à la prière et à la lecture des Écritures. Elle mangeait peu et dormait peu afin d'avoir du temps pour ses dévotions.
En 1093, le roi Guillaume Rufus attaque par surprise le château d'Alnwick. Le roi Malcolm et son fils aîné, Edward, sont tués. Margaret, déjà sur son lit de mort, mourut quatre jours après son mari.
Fête le 16 novembre.