Mannen var omkring 80 år gammal och dödsorsaken är fortfarande "okänd", efter att myndigheterna fått ett larm om att fartygets ägare, en brittisk medborgare, inte hade synts till på ett tag, säger AMN i ett uttalande.
Samma källa förklarade att larmet nådde myndigheterna klockan 17.30 och att delar av sjöpolisens lokalkommando, Lagos frivilliga brandmän och rättspolisen, som nu ansvarar för utredningen för att fastställa orsakerna och omständigheterna kring dödsfallet.
Räddningsenheten bestod också av delar av det medicinska akut- och återupplivningsfordonet (VMER) från det nationella institutet för medicinska nödsituationer(INEM), som till slut konstaterade dödsfallet på plats, säger AMN och förtydligar att när de gick ombord på fartyget "fann medlemmarna av sjöpolisen att mannen var medvetslös inne i segelbåten" och "inte visade några livstecken".
"Åklagarmyndigheten kontaktades, och kroppen transporterades därefter av element från de frivilliga brandmännen i Lagos till det medicinsk-juridiska kontoret i Portimão".