Enligt företaget ställdes 143 tåg in fram till kl. 08.00.
CP - Comboios de Portugal anger att av de 66 planerade regionaltågen var det 34 anslutningar som inte genomfördes och på Lissabons stadståg var 112 planerade och 71 inställda.
I Porto stad var 53 planerade för perioden, 26 hade ställts in och i fjärrtågen gjordes tre av de 12 planerade anslutningarna.
Flera CP-fackföreningar hade uppmanat till strejk idag, men på tisdagen efter ett möte med statssekreteraren för infrastruktur, Frederico Francisco, var det bara järnvägsunionen för den resande kommersiella granskningen(SFRCI) som upprätthöll strejken.
På tisdagen berättade José Manuel Oliveira från Federation of Transport and Communications Unions(Fectrans) för Lusa att organisationen och National Union of Railway Sector Workers(SNTSF) hade beslutat att avbryta strejken efter mötet.
Enligt José Manuel Oliveira kommer "fler privata möten nu att planeras med statssekreteraren för att diskutera vissa problem inom järnvägssektorn", inklusive "frågor relaterade till trafiksäkerhet".
Det andra fackförbundet som uppmanade till strejk, SINFA - Independent Union of Railway Workers, Infrastructures and Related, "följde också Fectrans och SNTSF:s ståndpunkt", sade José Manuel Oliveira.