Bertrank anställdes officiellt den 12 oktober, även om han aldrig ledde den portugisiska truppen i några matcher. Istället coachade han Lusitanos XV i de två inledande matcherna i den europeiska supercupen i år.
Bertrank behövde besöka Portugal oftare på grund av "den betydande ökningen av arbetsbelastningen" som orsakats av krav som "Wolves" har haft sedan deras deltagande i VM, sade FPR i ett uttalande.
"Detta skulle leda till att hans professionella relation med det franska idrottsministeriet avslutas, en situation som han vill undvika", säger organisationen.
Några dagar efter Portugals historiska VM-seger med 24-23 över Fiji under Patrice Lagisquet, utsågs Sébastian Bertrank officiellt till huvudtränare.
A passionate Irish journalist with a love for cycling, politics and of course Portugal especially their sausage rolls.