IST berättade för Lusa att signalerna togs emot på tisdagen, "några timmar efter" att nanosatelliten placerats i omloppsbana.
I ett uttalande sade IST, utan att specificera, att "data som rör närvaron av flygplan i avlägsna områden kommer endast att tas emot under de kommande veckorna".
I ett tidigare meddelande uppgav IST att de första uppgifterna skulle skickas ungefär en månad efter driftstarten.
ISTSat-1, som byggts av IST:s studenter och professorer, är placerad 580 kilometer från jorden, ovanför den internationella rymdstationen, astronauternas "hem" och laboratorium. Den kommer att användas för att testa en ny avkodare för meddelanden från flygplan som gör det möjligt att upptäcka dem i avlägsna områden och för att bedöma om det är möjligt att använda nanosatelliter för att ta emot signaler om flygplanens status, t.ex. hastighet och höjd, i flygsäkerhetssyfte.
De första signalerna som redan mottagits från nanosatelliten "analyseras av IST-teamet", som "på distans försöker förstå enhetens hälsostatus".
"Det portugisiska och internationella samfundet av radioamatörer har varit avgörande i denna process för att samla in information från satelliten", tillägger uttalandet från Instituto Superior Técnico, som tar emot information från ISTSat-1 vid kommunikationsstationen som är verksam vid IST:s hubb i Oeiras.
ISTSat-1, en kub som kostade cirka 270 000 euro, är den första nanosatelliten som konstruerats av en portugisisk universitetsinstitution och den tredje portugisiska satelliten som skickas ut i rymden, efter nanosatelliten Aeros MH-1 i mars och mikrosatelliten PoSat-1 1993, som företag bidrog till.
Nanosatelliten Técnico, som sköts upp inom ramen för Europeiska rymdorganisationens (ESA) program riktat till universitetsinstitutioner, kommer att ligga kvar i omloppsbana i mellan fem och 15 år innan den återinträder i atmosfären, men dess uppdrag kommer att vara av kortare varaktighet.
Tillsammans med ISTSat-1 skickades andra småsatelliter och vetenskaplig utrustning från utländska institutioner, företag och rymdorganisationer.