Диплом визначає три зони - A, B і C - археологічної чутливості, які враховують розташування об'єкта та його оточення, з акцентом на його зв'язок з навколишнім середовищем. З 1963 року Військовий музей класифікується як об'єкт, що становить суспільний інтерес.
Три окремі зони особливого захисту представляють різні типи робіт і попередніх заходів, які повинні бути виконані. Згідно з декретом-законом, "диплом визначає зону особливої охорони, яка враховує місце розташування та оточення об'єкта, а саме його зв'язок з ландшафтом, консолідованою міською структурою та іншими об'єктами, що мають значення для спадщини та/або містобудування".
Таким чином, у зоні А археологічне втручання має відбутися до початку робіт, щоб сприяти її збереженню. У зоні B, яка стосується урбаністичних втручань, що мають бути здійснені, повинні відбутися попередні археологічні розкопки, щоб можна було перевірити життєздатність втручань. Нарешті, зона С визначає територію, яка потребує постійного археологічного моніторингу.
Генеральна дирекція культурної спадщини у співпраці з Лісабонською міською радою запропонувала межі, призначені для захисту прилеглої території об'єкту, а Національна рада з питань культури схвалила їх.