Alors qu'il était évêque, l'un de ses détracteurs l'a accusé d'un crime qu'il n'avait pas commis. Les chrétiens de son diocèse ne l'ont pas cru et les accusations n'ont pas tenu, mais Narcisse a profité de ces allégations pour se retirer de son rôle d'évêque et devenir ermite dans le désert.

Après avoir été totalement disculpé des accusations portées contre lui, Narcisse est revenu à Jérusalem, plus âgé, mais plus fort et plus passionné par sa foi. Il reprit son poste d'évêque de Jérusalem.

Lorsque les diacres oublièrent de fournir de l'huile pour les lampes de l'église le samedi saint, Narcisse accomplit un miracle et transforma de l'eau en huile de lampe afin que les offices puissent commencer.

Lorsque sa vieillesse commença à se faire sentir, Narcisse pria Dieu de lui envoyer un évêque pour l'assister.

Dieu répondit en envoyant Saint Alexandre de Cappadoce, et tous deux prirent en charge le diocèse. Narcisse vécut très vieux et il est le saint patron contre les piqûres d'insectes.