Al suo debutto nella RNF, il team satellite di Aprilia, Miguel Oliveira, dopo aver superato il primo turno di qualifiche (Q1), si è assicurato il quarto posto sulla griglia di partenza delle due gare del weekend, con un tempo di 1.37.521 minuti.
Nell'ultimo tentativo, Marc Márquez, sei volte campione del mondo nella categoria principale, ha ottenuto il miglior tempo in Q2, in 1.37.226 minuti, battendo il record dell'Autódromo Internacional do Algarve e ottenendo la 64ª "pole" della sua carriera in MotoGP.
Dopo le difficoltà avvertite il giorno prima, nelle prime prove libere, in cui era rimasto fuori dalla top-10, Márquez ha ammesso di non sapere cosa fosse successo.
"Oggi è andata meglio, partiremo dalla 'pole position' nel pomeriggio [nella gara sprint] e domenica [nel Gran Premio] e questo è importante. La gara sarà molto difficile, contro le Ducati, che hanno un ritmo molto elevato, ma siamo partiti davanti, il che è già un grande vantaggio", ha detto.