IPMA anger att vädret på kontinenten och på öarna kommer att påverkas av "en kallfront med måttlig till stark aktivitet, i samband med ett lågtryck med centrum i nordvästra delen av Iberiska halvön".
"Perioder av regn väntas, som ibland kan vara kraftiga, i Minho och Douro Litoral från slutet av den 31 december, vilket sammanfaller med nyåret, och nederbörden kommer att utvidgas till resten av landet från morgonen den 1 januari".
I söder väntas regnet endast komma på eftermiddagen och förväntas minska i intensitet under dagen.
Trots regnet väntas för närvarande inga vädervarningar för helgen - de aktiva varningarna är gula (den lägsta nivån) och upphör på fredag morgon och omfattar distrikten Viana do Castelo, Braga, Vila Real , Porto, Aveiro, Viseu och Coimbra.
På grund av att kallfrontsytan passerar, kommer vinden enligt prognoserna att öka i styrka, främst från sydväst.
"Temperaturerna kommer att förbli milda, med en högsta temperatur som varierar mellan 14 och 19 grader Celsius och en lägsta temperatur som varierar mellan 7 och 14 grader Celsius".
För Madeira förutspår IPMA också nederbörd mellan fredag och söndag, svag till måttlig vind och milda temperaturer, med maximalt 20-22 grader Celsius och minimalt 17-18 grader.
På Azorerna är det däremot en temperatursänkning, med minimikrav på 8/9 grader och maximikrav på 14/15 grader.
Under fredagen kommer de centrala och östra grupperna att drabbas hårdast av regn i samband med kallfrontens passage och vinden kommer att blåsa med vindbyar mellan 70 och 80 kilometer i timmen för att sedan bli måttlig.