IPMA hade tidigare placerat distrikten Bragança, Viseu, Guarda, Vila Real, Setúbal, Santarém, Leiria, Lissabon, Castelo Branco, Aveiro, Coimbra, Viana do Castelo, Braga och Porto under gul varning.
I ett nytt uttalande utvidgade institutet den gula varningen till distrikten Faro och Beja på grund av prognosen för skurar, ibland tunga, och ibland med hagel och frekventa och spridda åskväder.
De 16 distrikten på kontinenten kommer att vara under gul varning fram till 18:00 på lördag.