José Manuel Rodrigues uttrycker för egen, parlamentets och Madeiras räkning sin "djupa bestörtning" över flickans död i denna attack, som också dödade två andra barn.
Det portugisiska barnet, som föddes den 15 oktober 2014, är registrerat vid det portugisiska konsulatet i Manchester.
Den brittiska polisen bekräftade att attacken, som ägde rum i Southport i Storbritannien, utfördes av en 17-årig pojke, som redan har gripits, och orsakade tre barns död - förutom den 9-åriga portugisiska flickan är de andra 6 och 7 år gamla.
Ytterligare åtta minderåriga skadades i attacken, varav två allvarligt, liksom två vuxna, som också vårdas på sjukhus i ett allvarligt tillstånd.
Barnen ska ha deltagit i ett evenemang på en dansskola inspirerad av den amerikanska artisten Taylor Swift när den misstänkte kom in beväpnad med en kniv och började attackera dem.
Enligt polisen skadades de vuxna när de "modigt" försökte skydda barnen från attacken.