I Algarve började skolåret med att minst 126 lärare saknades, vilket kommer att påverka cirka 13 000 elever.
Enligt en rapport från Sul Informação är de grupper som har störst brist de som undervisar i specialpedagogik, portugisiska och historia.
"Generellt sett [och jämfört med föregående år] ökar bristen på lärare eftersom det finns fler timplaner som ska fördelas till specifika grupper", säger João Pereira från FENPROF till Sul Informação.
Enligt samma källa var de kommuner som hade störst lärarbrist Faro (18), Lagos (15), Silves (14) samt Portimão, Loulé och Olhão (13).
Även om lärarbristen påverkar skolor över hela landet är Algarve, Alentejo och Lissabon de områden som drabbats hårdast.
"I norr utbildas fler lärare, lärare som i slutändan också väljer att stanna kvar", förklarar João Pereira.