روم میں پجاری اور علم الہٰیات کے لیے اپنے حکم کے بعد وطن واپس آ گئے اور مختلف پادری اور علمی کاموں کو دوبارہ شروع کیا۔ انہوں نے کہا کہ سب سے پہلے معاون بشپ بن گیا اور, میں 1964, کراکو کے آرچ بشپ اور دوسری ویٹیکن کونسل میں حصہ لیا.



16 اکتوبر 1978ء کو وہ پوپ منتخب ہوئے اور اس کا نام جان پال دوم لیا گیا۔ ان کا غیر معمولی رسولی جوش، خاص طور پر خاندانوں، نوجوانوں اور بیماروں کے لیے، انہیں پوری دنیا میں بے شمار پادری دوروں کی طرف لے گیا۔ انہوں نے چار مواقع پر پرتگال کا دورہ کیا اور فاطمہ بہن لوسیا کے آخری باقی بصیرت سے ملاقات کی۔



2 اپریل 2005ء کو روم میں پرامن طور پر وفات پائی۔ اسے پوپ فرانسس نے 27 اپریل، ایسٹر 2014 کے دوسرے اتوار کو کینن کیا تھا۔